3.02 Phoenix - Феникс
(эфир 8 октября 2003)
В то время, как Кларк и Джонатон сражаются между друг другом, Лекс возвращается в Смолвиль. Кларк должен иметь дело с главой криминального мира Морганом Эджем, который сопровождает его в Смолвиль. Лекс должен определить, кто пытался убить его - Лайнел или Хелен.

3.03 Extinction - Угасание
(эфир 15 октября 2003)
Кларк обнаруживает, что кто-то охотиться на людей пораженных осколками метеорита. Он узнает, что следущая жертва это Лекс. Кларк использует свою силу, чтобы спасти Лекса, но убийца застает Кларка врасплох, узнав о его слабости и стреляет в него пулями из криптонита.

3.04 Slumber - Сон
(эфир 22 октября 2003)
Кларку снится молодая напуганная девушка, которой нужна помощь. И он обнаруживает, что эта девушка его соседка, которая лежит в коме уже несколько лет. Кларк обращается за помощью к Лане, чтобы узнать причины этого, которой грозит смертельная опасность. Тем временем, Лайнел требует, чтобы Лекс прошел психологическу проверку, перед тем как он наймет его.

3.05 Perry - Перри
(эфир 29 октября 2003)
Перри Уайт -многообещающий журналист, чья карьера была уничтожена Лайнелом Лютером, приезжает в Смолвиль в поисках историй о инопланетянах для бульварной газеты. Несмотря опьянение, Перри верит, в то что видел, как Кларк использовал его супер-скорость, поэтому он разрабатывает опасный план раскрытия силы Кларка.Тем временем, Лекс узнает, что у Перри есть информация о темном прошлом его отца, Лайнела.

3.06 Relic - Реликвия
(эфир 5 ноября 2003)
Кларк узнает, что Джор-Эл был уже на земле 40 лет назад. Дядя Ланы, которому был вынесен приговор за убийство его жены 40 лет тому назад, показывает ей фотографию мужчины, он верит, что этот человек убил ее тетю, Лана потрясена увидев на фотографии скитальца похожего на Кларка. Уверненный, что этот мужчина - Джор-Эл, раследование Кларка приводит его к медальону с криптонитом, что позволяет ему видеть отрывки прошлого, и он узчнает,что Джор-Эл начал здесь жить за долго до появления Кларка на земле.

3.07 Magnetic - Магнитный
(эфир 12 ноября 2003)
Кларк становится подозрительным, когда Лана неожиданно становится ближе с школьным приятелем и начинает вести себя, как бунтарка, что в конечном счете оборочивается для нее тюремной камерой. Подозрения Кларка подтверждаются, когда он обнаруживает, что у нового друга Ланы есть магнетические способности, которые позволяют ему передвигать предметы и изменять чувства людей. Когда Кларк пытается осободить Лану от этой зависимости, которая контролирует ее, она пытается убить Кларка. Тем временем, Лекс обнаруживает, что Хлоя все больше углубляется в расследование прошлого его отца, он предлагает объединить их усилия против Лайнела.

3.08 Shattered - Разрушение
(эфир 19 ноября 2003)
Лекс определяет место нахождения Моргана Эджа и уговаривает его признаться в том, что у него были грязные делишки с Лайнелом, но прежде чем Лекс может передать его властям, кто-то пытается убить его в особняке. Чудом спасшийся Лекс убегает и просит у Кларка помощи. Когда Кларк возвращается в особняк для расследования, он не находит ничего необычного и начинает сомневаться, было ли это в действительности, особенно после того, как Лайнел заявляет, что у Лекса был психический срыв и он должен быть помещен в больницу.

3.09 Asylum - Приют
(эфир 14 января 2004)
Трое бывших противников Кларка обращаются к Лексу, чтобы заручиться его помощью и заманить Кларка в больницу, после того как они узнают, что Лайнел потребовал лечить Лекса с помощью шокотерапии, чтобы стереть его память. Но дела удут скверно, когда злодеи обманывают Лекса и используют криптонит, чтобы украсть силы Кларка. Тем временем, Лана встречает загадочного незнакомца в больнице.

3.10 Whisper - Шепот
(эфир 21 января 2004)
Кларк временно слепнет, когда пытается останавить ограбление, он использует термозрение, которое случайно отржается в криптаните и направляется обрано в его глаза. Но вкоре, чтобы компенсировать недостаток зрения, у него проявляется суперслух. Как и в других случаях при появление различных способностей, Кларк не может контролировать этот дар.

3.11 Delete - Уничтожение
(эфир 28 января 2004)
Кларк и Лана, каждый из них делает попытку уничтожить жизнь Хлои, по неизвестным причинам после того, как они получают письмо из Института Саммерхолт. Кларк должен найти отправителя этого письма, после того как Хлоя разоблачит их, она обнаружила доказательство того, что они проводят исследования контроля над разумом человека. Хлоя осознает, что они должны попытаться убить ее для того, чтобы сохранить это в тайне. Лана решает арендовать квартиру над кафе Адама, не смотря на то, что она чувствует, что он скрывает нечто опасное о своем прошлом.

3.12 Hereafter - Грядущее
(эфир 4 февраля 2004)
Кларк обнаруживает, что его одноклассник Джордн может предвидеть будущее, но он ужасается когда Джордан говорит ему, что видит Лану погибающую на пожаре в ближайшие несколько дней. Хлоя расследует поднаготную Адама, из-за егоподозрительного поведения. И она обнаруживает несколько волнующих подробностей.

3.13 Velocity - Скорость
(эфир 11 февраля 2004)
Пит умышленно проигрывает уличную гонку и организаторы угрожают его жизни, поэтому он просит Кларка использовать свою силу, чтобы остановить их. Кларк взбешен из-за того, что тот поставил его в такое положение, он должен помочь ему и сохранить секрет. Тем временем, Джонатон начинает сожалеть о последствиях его сделки с Джор-Элом.

3.14 Obsession - Одержимость
(эфир 18 февраля 2004)
Кларк вынужден использовать свои силы перед Алисией, новой девочкой в школе, он удивлен, обнаружив у нее есть свои собственные силы. Они создают между собой союз, связанный их общим секретом, но все меняется после того как Алисия становится одержимой, узнав, что Кларк разделяет сексрет с кем-то еще, особенно с Ланой. Тем временем, Лана просит Лекса получить сведения о Адаме.

3.15 Resurrection - Воскрешение
(эфир 25 февраля 2004)
Кларк вынужден использовать свои силы перед Алисией, новой девочкой в школе, он удивлен, обнаружив у нее есть свои собственные силы. Они создают между собой союз, связанный их общим секретом, но все меняется после того как Алисия становится одержимой, узнав, что Кларк разделяет сексрет с кем-то еще, особенно с Ланой. Тем временем, Лана просит Лекса получить сведения о Адаме.

3.16 Crisis - Кризис
(эфир 3 марта 2004)
Кларк вынужден использовать свои силы перед Алисией, новой девочкой в школе, он удивлен, обнаружив у нее есть свои собственные силы. Они создают между собой союз, связанный их общим секретом, но все меняется после того как Алисия становится одержимой, узнав, что Кларк разделяет сексрет с кем-то еще, особенно с Ланой. Тем временем, Лана просит Лекса получить сведения о Адаме.

3.17 Legacy - Наследие
(эфир 14 апреля 2004)
Когда Джонатан начинает вести себе странно, Кларк верит, что Джо Эл отправляет сообщения Джонатону, через ключ, и это становиться причиной того, что отец уходит из семьи. Кларк спускается в пещеры, чтобы столкунться лицом к лицу со своим биологическим отцом, но Лайнел ловит его там и начинает собирать кусочи мозаики воедино, поручая это дело надежному доктору Суонну. Два милиардера стлкиваются между собой, и здесь открываются истинные мотивы Лайнела.

3.18 Truth - Истина
(эфир 21 апреля 2004)
Когда Хлоя случайно вдыхает пары необычного крипто-газа,то она открывает, что это действует, как сываратка правда для тех, кто с ней разговаривает. Хлоя решает использовать свою новою способность и открыть секрет Кларка. Но ее новая сила может привести к фатальном результатам и Кларк должен найти противоядие прежде чем он раскроет о нем правду или хуже того, умрет.

3.19 Memoria - Мнемоника
(эфир 28 апреля 2004)
Веря, что ключ сообщивший о прошлом отца Лекса был потерян, когда его память была стерта, Лекс решает присоединииться к эксперементальной программе доктора Гарненра, вспомнив все он сможет выдать отца ФБР. Зная, что Лекс раскроет его секрет, если вернет память, Кларк решает остановить его, но его ловит Лайнел и доктор, и подвергают такому же радикальному лечению, что Лайнел может выяснить секрет Кларка.

3.20 Talisman - Талисман
(эфир 5 мая 2004)
Когда индеец Киуатчи крадет мифический нож из пещеры, ему даруется супер сила, очень похожая на силу Кларка, потому что молодой человек верит, что он легендраный Неман, человек, который упал со звезды. Кларк узнает, что легенда предсказывает, что нож мог убить Немана и пытается исправить это, прежде чем молодой индеец сможет использовать это на Лайноле.

3.21 Forsaken - Покинутый
(эфир 12 мая 2004)
Кларк решает рассказать Лане свой секрте, чтобы они наконец то смогли быть вместе. Тем временем, агент ФБР похищает и пытает Пити, чтобы тот открыл ему секрет Кларка. Также, Лекс паникует после того, как ФБР дает ему 24 часа чтобы передать информацию о его отце либо угодить за решетку, помощь приходить совершенно из неожиданного источника.

3.22 Covenant - Сделка
(эфир 19 мая 2004)
Все меняется, когда Кара, симпатичная девушка с суперсилой, которая прибыла с Криптониа, пытается убедить Кларка выполнить сое предназначение. Кларк обращается к родителям за советом, но он шокирован, когда Кара заставлетя Джонатона рассказать о его договоренности с Джо-Элом. Также Кларк делает открытие, которое предопределяет его отношения с Лексом, и отношения Кларк и Лана достигают последней стадии.